Alguna que otra vez digitalizo documentos, el mayor problema es la textura y color de fondo de los papeles, y por otra la resolución utilizada en el escaneado, no es lo mismo un documento escaneado a 200ppp que a 300ppp o 600ppp.
Si escaneas en color, deberás hacer algún ajuste más con el programa de escaneado para que los colores te resulten más "reales", si tu programa para escanear es de los de andar por casa pues date por jorobado/a, en casa unos LiNUX y el programa que uso, que no es ninguna maravilla, me da todo tipo de control sobre cómo se va a escanear.
¿Hacer fotos a los documentos? Es una opción, pero es cara, incómoda, lenta, trabajosa y los resultados no están a la altura de lo que un escáner barato puede hacer en cuanto a resolución si hablamos de hojas tamaño A4.
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