Correcto, el problema estriba en que las fotografías en sí debieron hacerse respetando los valores de exposición, balance de blancos, etc... es decir, que todas tuvieran los mismos parámetros, y después montar la panorámica...
Por otro lado... viendo el resultado de tu panorámica... ¿Quien fuel el que dijo que el mundo NO es redondo? 
Perdón por el Off Topic
Prefiero morir en pié a vivir arrodillado
Piensa cada foto... siente cada foto... comprende cada foto... y sólo de esa manera podrás disfrutar de la fotografía
Canon: EOS 33, EOS 350D-BGE3, EF-S 17-85 f/4-5'6 IS USM, EF 50mm f/1'8 II, ET 12EF-II, 580EX, 430EX
Sigma: AF 12-24 f/4'5-5'6 EX DG HSM, AF 70-200 f/2'8 APO EX HSM, 2X APO Teleconverter
Manfrotto: 680B, Slik PRO 330DX, LowePro: Mini Trekker AW, Crumpler: Pretty Boy XXL
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