Bueno buscando un poco he encontrado algo no muy bonito visualmente, pero realmente efectivo.
software - Olli Savolainen
Una vez lo instalas por defecto, seleccionas las fotos, o la carpeta entera donde estén, y con el botón derecho tienes la opción de autorotate.
Una vez finaliza, al entrar en la carpeta ya tienes todas las fotos rotadas.
En Bridge se ven perfectamente una vez giradas, con lo que no afecta mas que al explorer.
( por lo que he visto la rota y cambia el EXIF a orientación NORMAL para que el resto de programas la interpreten en vertical ).
Ya diréis si encontráis algo mejor.
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