Hola, he visto ahora el hilo (hace tiempo que no entraba en el foro) y le he echado un vistazo a las dos imágenes que has enlazado.
Creo que el problema podría venir de las opciones de "chroma subsampling". El nombre es un poco críptico pero ahora explico de qué va.
Se trata de la barra desplegable de opciones que tienes dentro del diálogo de "opciones avanzadas", al exportar en JPEG. La barra está a la derecha de las casillas que has estado tu probando de activar o desactivar.
Esta opción ajusta la proporción entre la resolución de la tres componentes de la imagen, en formato Y Cb Cr. La primera componente es la luminosidad, las dos siguientes dos componentes de crominancia (color).
El formato JPEG en origen se pensó que utilizaría por defecto el doble de resolución para la componente de luminosidad que para las de color. Así se aprovecha el hecho de que nuestro ojo es más sensible a pequeñas variaciones de luminosidad de lo que lo es a pequeñas variaciones de tonalidad del color. Con esa trampa, se reduce bastante la cantidad de información que es necesario almacenar, y por tanto el tamaño del archivo, sin que nuestro ojo note demasiado la pérdida. Las cámaras fotográficas por defecto lo hacen así.
Pero los programas de retoque fotográfico pueden variar esa proporción, para conservar mejor la calidad de la imagen, a expensas de un archivo JPEG de mayor tamaño. GIMP te permite ajustar eso al exportar a JPEG, con la barra de opciones que te he comentado. Las Canon EOS usan de entrada usan la opción de chroma subsampling que GIMP llama "4:2:2 horizontal (chroma halved)".
Pero tu puedes escoger otras, al grabar en GIMP. Y hay otros programas de sobras conocidos (Photoshop) que las cambian sin tu saberlo cuando modificas el valor de calidad del archivo JPEG. Cuando le pones una calidad alta, Photoshop automáticamente cambia al modo que Gimp llama "4:4:4 (best quality)", en que se da la misma resolución a todas las componentes, de modo que el tamaño del archivo prácticamente se duplica.
Bien, pues resulta que no todos los dispositivos que leen imágenes JPEG entienden bien todas las opciones posibles de subsampling. De modo que puede no mustren en absoluto una imagen con opciones diferentes a la que en principio establecía el estándar JPEG.
Yo no me he encontrado con ese problema en impresoras de laboratorio ... pero sí al intentar ver imágenes en televisores, concretamente con algún modelo de Sony Bravia, que tiene en su casa mi padre. A él le pasaba que no podía ver la mayoría de imágenes retocadas en Photoshop, porque se habían grabado en el modo 4:4:4, y el televisor Sony no las reconocía.
De las imágenes que has puesto, he visto (con exiftool) que ninguna de las dos usa la opción "4:2:2 horizontal", que es con la que graban la imagen las Canon EOS, y la más estándar.
La primera foto que pusiste, la que la impresora del laboratorio no podía leer, está en el formato "4:2:2 vertical". La segunda foto, la que sí reconocía la impresora, está en el formato 4:4:4, en teoría el de más calidad, pero la resolución de esta foto es menor que la original: 1772x2362 píxeles, en lugar de 2484x3312.
Por tanto, te recomiendo que te asegures de exportar las fotos seleccionando "4:2:2 horizontal", así te evitarás problemas.
Las otras "opciones avanzadas" que has probado de desactivar al exportar, no creo que sean la causa del problema. Lo que hacen cuando las desactivas es reducir la cantidad de datos EXIF que se almacenan en la imagen, la versión en miniatura de la imagen para previsualización rápida, etc. Por ejemplo, en la segunda foto que has puesto, con esas opciones desactivada, se ha perdido en el archivo toda la información referente a las condiciones de captura de la foto (modelo de cámara, focal del objetivo, valores de exposición, etc.)
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