¿Y ese retardo en aplicar el efecto no te pasa al reproducirlo en la línea de tiempo? es raro desde luego.
Podrías probar a editarlo en Audition o Soundbooth. Según la versión de Premiere, te permite llevar el audio directamente sin exportar nada, haciendo click derecho sobre el clip si no recuerdo mal.
Saludos.
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