Con 240 gb, a menos que te administres muy, muy bien, veo complicado que te sirva para proyectos.
Yo diría que sistema y aplicaciones en el SSD. Si te entra algún proyecto en ese SSD puede ser la mejor opción en cuanto a velocidad (aunque ampliaría la ram a 16 gb porque con FCPX se nota mucho y no va a usar apenas el SSD para memoria virtual).
Sino, los proyectos, material, etc... En el disco duro interno si es de 7200 rpm (no precisas si tu iMac es de 21,5" o 27" y sólo estos últimos llevan discos de 7200 rpm) y si es de 5400 rpm mejor casi el externo. Aunque es sencillo: cuando tengas los dos pásales un test de velocidad y elige el más rápido como disco de trabajo y el otro como almacen.
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