Configura una secuencia que se ajuste a las especificaciones de los clips que saque la cámara en cuanto a resolución, relación de aspecto, fps, etc.
Aunque siempre se pueden elegir especificaciones diferentes a las del clip si lo haces con conocimiento de causa: por ejemplo es posible que tu cámara grabe en 4K pero quieras editar y exportar un determinado proyecto en 1080. Lo normal o más común es adaptarse a las especificaciones del clip nativo.
El formato/codec de origen en realidad no importa a la hora de configurar la secuencia.
Saludos.
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