Hola Nacho, tengo el mismo problemita que vos y me temo que no queda otra que sacar en modo manual.
En mi caso, a menudo utilizo el 580 ex II como relleno muy suave, compensando la expo -2 o-3 puntos, para fotografía de aves en ambientes naturales. En modo Av podría hacer todo más rápido, pero al bloquear la expo , se bloquea la del flash mediante el pre destello, que para fotografía de animales es un problema aparte porque los pone en sobre aviso y muchas veces se vuelan, cambiándose además los valores de expo de luz natural fijados al principio, con lo que obtengo un fondo bien expuesto y el sujeto principal la mayoría de las veces sobre exp. Un verdadero dolor de huevos.

A mi entender, el flash debería tener su propio bloqueador de exposición, que en mi caso no interesa usar y la cámara el suyo aparte, para poder seguir usando las tan útiles funciones Av o Tv.
A ver si los ingenieros de canon se ponen al servicio...
Un saludo