Buenas noches

Pifa, honestamente es muy difícil que podamos percatarnos de diferencia alguna entre ambas fotografías. Te sugiero que cargues archivos originales (si quieres un detalle cropeado, para que no pese tanto) y por supuesto que no utilices compresión alguna, ya que de lo contrario es casi ciencia ficción poder apreciar el problema que comentas.
Y no te olvides de no eliminar el EXIF, ya que de la supuesta imagen disparada con la 1dsMkIII lo borrastes, sin embargo con la 5D no fué así. De hecho el formato de la imagen se aproxima aun 3/4 y no a un formato original.

De todas formas quizás te ayude saber que puedes ajustar el enfoque de tus lentes para la MKIII. Con las 1ds hay hasta 20 pasos de reajuste. Bueno eso suponiendo que se trate de afilamiento en el enfoque, ya que por definición se pueden entender muchas cosas.

Otro cosa importante es que disparas a F4 y 1/60 de segundo con un tele de 188 mm y una ISO 50. Sube la ISO a 100, trabaja con aperturas de alrededor de f8 disparando almenos a 125. Si comparas bajo esas condiciones, tendrás datos más objetivos del rendimiento real entre una cámara u otra. En cámaras con tanta resolución, si no has hecho la prueba con un disparador y a 1/60 con un tele, es probable que una de las imágenes pueda verse borrosa, cuestión de pulso. Al ser el formato considerablemente mayor se aprecian las imperfecciones del disparo mucho más.

Suerte!

Pd: El 85% de una buena foto está en quién dispara y su dominio de la luz, pero tampoco hay que ponerse tan estiraos porque alguien se compre una cámara profesional. Se me ocurren cientos de motivos para hacerlo, aunque se sea un simple aficionado.