Si las tienes visibles (el ojo seleccionado en todas las capas), haces clic con el botón derecho del ratón sobre la capa principal por ejemplo y seleccionas "Combinar visibles".
Si acaso quisieses luego trabajar con alguna característica avanzada, tendrías que seleccionar "Acoplar imagen", pero lo que preguntas en concreto es la primera de las cosas que te he dicho.
Ya dirás si te entendí bien.
Saludos,
Jorge


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