Una prueba màs podrias hacer. Desinstalar todo el software de la camara, volver a instalar y probar el EOS Utility de nuevo.
Cuando conectes la cámara , se abre el EOS y en vez de pasar las fotos a través del software, prueba a utilizar el menú de la pantalla de la cámara.
Yo lo hago así (normalmente utilizo la opcion descargar fotos nuevas por aquello de no duplicarlas en el PC) y no me da ningún problema.
Suerte
Canon EOS 50D + 24-105 f/4 L IS + 50 f/1,4 USM + 70-200 f/2.8 L + Tamron 17-55 f/2.8
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